Efficient detection and amelioration of Long Branch Attraction (LBA) artefacts in phylogenetic analyses
  • Metaadatok
Tartalom: http://hdl.handle.net/10831/73737
Archívum: EDIT
Gyűjtemény: Szakdolgozatok
Szakdolgozatok (TTK)
Szakdolgozatok (Fizikai Intézet)
Cím:
Efficient detection and amelioration of Long Branch Attraction (LBA) artefacts in phylogenetic analyses
Létrehozó:
Lénárd Lajos Szánthó
Közreműködő:
Gergely J. Szöllősi
Dátum:
2021-05-31
Téma:
phylogenetics
long branch attraction
compositional site heterogeneity
szakdolgozat
Tartalmi leírás:
In this thesis fastCAT, a novel method will be introduced that aims to efficiently detect and ameliorate long branch attraction (LBA) artefacts in phylogenetic inference. The fastCAT method will be validated on simulated dataset, 3 real-world datasets that are well-known to be prone to LBA and a fourth dataset which is still debated. Our results prove that fastCAT is a consistent, sensitive and fast method to answer deep phylogenetic questions reliably.
Nyelv:
angol
Típus:
info:eu-repo/semantics/masterThesis
hallgatói dolgozat
Formátum:
application/pdf
Azonosító:
elte:IW5F5E
Létrehozó:
info:eu-repo/semantics/closedAccess